Oct. 6th, 2011

murrka: (knitting)
Я, наконец-то, взяла в руки спицы, и меня пробралооооо.... Покамест вяжу простенькое одеялко-трансформер (посмотрим что получится), а т.к. оно простенькое, голова не занята и в ней роится. Ох, скорей бы довязать уже!!! А то вот тут например можно повеситься от хочу-хочу-хочу.
murrka: (knitting)
Я, наконец-то, взяла в руки спицы, и меня пробралооооо.... Покамест вяжу простенькое одеялко-трансформер (посмотрим что получится), а т.к. оно простенькое, голова не занята и в ней роится. Ох, скорей бы довязать уже!!! А то вот тут например можно повеситься от хочу-хочу-хочу.
murrka: (Тошка)

Тошка пересмотрела Спайдермена у свекров, теперь бредит каким-то чудовищем вылезающим из канализации. Вчера это чудовище вылезало из канализации и откусывала ей голову.
я: ну подумаешь голова! без головы тоже неплохо
Тошка, подумав секунд 30: а как же я буду говорить?

Дочь своего отца!


murrka: (Тошка)

Тошка пересмотрела Спайдермена у свекров, теперь бредит каким-то чудовищем вылезающим из канализации. Вчера это чудовище вылезало из канализации и откусывала ей голову.
я: ну подумаешь голова! без головы тоже неплохо
Тошка, подумав секунд 30: а как же я буду говорить?

Дочь своего отца!


murrka: (Default)
Проблема: неспецифичное связывание белка с отрезком ДНК.
Возможное решение: поменять буффер реакции (EMSA).
Из литературы выужено три буффера: X, H and I, буквы взяты из головы.
Х:                                      H:                                          I:                                      исходный (неспеццифичный) буффер:
Tris pH 7.5  10mM     HEPES pH8  20mM             Tris pH8      20mM                           1mM
glycerol 5%                                        20%                                        10%                              10%
EDTA  0.5mM                                     0.5mM                                   0.1mM                             -
MgCl2  1mM                                        5mM                                      -                                     1mM
DTT  0.5mM                                        1mM                                       0.1mM                         1mM
NaCl  100mM                                       -                                             50mM                              -
                                                                                                                                       ZnAc2   0.1mM
В реакцию добавлено 60fmole меченого ДНК, 4мкг ядерного экстракту и 2мкг poly(dIdC).

Результат: буфферы I и исходный связывают неспецифично и сильно, картинка загляденье. Буфферы Х и Н вроде бы дают специфичную картинку, но очень слабую, плохоотличимую от фона. Добавление BSA в количестве 20мкг убивает реакцию нафиг во всех случаях.

Кто возьмется проанализировать и сказать мне в какую сторону брести чтобы получить хороший шифт, на который еще и супершифт можно повесить?
murrka: (Default)
Проблема: неспецифичное связывание белка с отрезком ДНК.
Возможное решение: поменять буффер реакции (EMSA).
Из литературы выужено три буффера: X, H and I, буквы взяты из головы.
Х:                                      H:                                          I:                                      исходный (неспеццифичный) буффер:
Tris pH 7.5  10mM     HEPES pH8  20mM             Tris pH8      20mM                           1mM
glycerol 5%                                        20%                                        10%                              10%
EDTA  0.5mM                                     0.5mM                                   0.1mM                             -
MgCl2  1mM                                        5mM                                      -                                     1mM
DTT  0.5mM                                        1mM                                       0.1mM                         1mM
NaCl  100mM                                       -                                             50mM                              -
                                                                                                                                       ZnAc2   0.1mM
В реакцию добавлено 60fmole меченого ДНК, 4мкг ядерного экстракту и 2мкг poly(dIdC).

Результат: буфферы I и исходный связывают неспецифично и сильно, картинка загляденье. Буфферы Х и Н вроде бы дают специфичную картинку, но очень слабую, плохоотличимую от фона. Добавление BSA в количестве 20мкг убивает реакцию нафиг во всех случаях.

Кто возьмется проанализировать и сказать мне в какую сторону брести чтобы получить хороший шифт, на который еще и супершифт можно повесить?

Profile

murrka: (Default)
murrka

November 2015

S M T W T F S
1234567
891011121314
15161718192021
22232425262728
2930     

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Powered by Dreamwidth Studios