murrka: (purple cat)
[personal profile] murrka
Так, я скоро начну бросаться на людей.
Имеем почти total cell extract белков, ну хорошо, не тотал, половину, но все равно много. Я его гоню на SDS-PAGE, разрезаю на маленькие кусочки и делаю trypsin in gel digestion строго по протоколу. Последним этапом сушу в спидваке все что из геля накапало и развожу обратно в масспековом буффере. Загоняю всю эту бодягу в масспек.
Масспек корчит мерзкую рожу и показывает, что Т-штучка у него засорилась после первой же пробирки. Колонна засоряется позже. Ни у кого с такой частотой не засоряется, только у меня. Я взяла из digestion solution 10 микролитров (из 60-ти), высушила их и развела в том же количестве масспекового буфера. Что бы там ни засоряло колонну, его должно стать в 6 раз меньше.
Нефига, после первой же пробирки (а у меня их 64 на эксперимент) Т-штучка начала засоряться.

КАКОГО ЧЕРТА?!

ЧТО ЭТО, БЭРИМОР?!!!!!

Что может засорять эту гадскую Т-штучку вместе с колонной?!

(no subject)

Date: 2014-08-06 06:38 pm (UTC)
From: [identity profile] misterspok.livejournal.com
Я сразу оговорюсь, что Масспек не знаю от слова совсем, но может у тебя там полиакриламид попал в digestion solution? После trypsin in gel digestion? Или это совсем ерунда?

(no subject)

Date: 2014-08-06 06:40 pm (UTC)
From: [identity profile] misterspok.livejournal.com
Кстати, самое лучшее решение в такой ситуации- звонить в компанию, у которой купили прибор, требовать technical support и пусть они тебе накидают вариантов. На своем горьком опыте, таким образом можно сильно сэкономить время и нервы

(no subject)

Date: 2014-08-06 09:51 pm (UTC)
From: [identity profile] murrka.livejournal.com
До сих пор мне казалось, что та сторона понимает о чем говорит. Сегодня я ее взяла за шкирку и потрясла. Ничего не вытрясла, надо разбираться самостоятельно. У меня как раз две недели в Израиле - будет чем заняться.
Кстати, если тебе чего передать - лови момент :)

(no subject)

Date: 2014-08-06 06:47 pm (UTC)
From: [identity profile] yelya.livejournal.com
Wtf T-shtuchka?
Try doing some sort of filtration before loading on the column.
What kind of a column is this?
What kind of mass spec are you using?

(no subject)

Date: 2014-08-06 07:21 pm (UTC)
From: [identity profile] murrka.livejournal.com
Т-штучка это куда с одной стороны втыкают колонну, а с другой сэмпл. Точные спецификации я напишу позже.

(no subject)

Date: 2014-08-06 09:42 pm (UTC)
From: [identity profile] murrka.livejournal.com
The machine is LTQ XL and the beads are Jupiter 4u proteo 90A

Пошла читать траблшутинг к машине.

Profile

murrka: (Default)
murrka

November 2015

S M T W T F S
1234567
891011121314
15161718192021
22232425262728
2930     

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Powered by Dreamwidth Studios